Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBL7Q96S82 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBL7Q96S82 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms