Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms