Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms