Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms