Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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FAM3DQ96BQ1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3DQ96BQ1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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