Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF4Q8WXU2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms