Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FNDC9Q8TBE3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms