Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA6DQ8NFY4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms