Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HJURPQ8NCD3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms