Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC117Q8IWD4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC117Q8IWD4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms