Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNRD3Q86VQ6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNRD3Q86VQ6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms