Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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