Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
WDR53Q7Z5U6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
WDR53Q7Z5U6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms