Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PREX2Q70Z35 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PREX2Q70Z35 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms