Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCD1Q6ZMY3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms