Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMCO3Q6UWJ1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMCO3Q6UWJ1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMCO3Q6UWJ1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMCO3Q6UWJ1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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