Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM88Q6PEY1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM88Q6PEY1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM88Q6PEY1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM88Q6PEY1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM88Q6PEY1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM88Q6PEY1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM88Q6PEY1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM88Q6PEY1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM88Q6PEY1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM88Q6PEY1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM88Q6PEY1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms