Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UFSP1Q6NVU6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms