Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG16L1Q676U5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms