Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PXDC1Q5TGL8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms