Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LDLRAP1Q5SW96 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LDLRAP1Q5SW96 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms