Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL12Q53G59 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms