Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms