Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CERKLQ49MI3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms