Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY00

TSGA10IP, Testis-specific protein 10-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA10IPQ3SY00 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSGA10IPQ3SY00 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSGA10IPQ3SY00 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSGA10IPQ3SY00 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSGA10IPQ3SY00 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSGA10IPQ3SY00 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSGA10IPQ3SY00 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSGA10IPQ3SY00 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSGA10IPQ3SY00 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms