Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms