Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP5B1Q2VPB7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP5B1Q2VPB7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms