Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME3Q16798 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME3Q16798 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME3Q16798 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME3Q16798 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME3Q16798 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME3Q16798 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ME3Q16798 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME3Q16798 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME3Q16798 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME3Q16798 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ME3Q16798 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME3Q16798 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME3Q16798 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ME3Q16798 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME3Q16798 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME3Q16798 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME3Q16798 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME3Q16798 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
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