Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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