Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA4Q16363 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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