Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
GRIK4Q16099 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK4Q16099 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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