Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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