Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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