Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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