Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SLC4A2-218ENST00000494125 782 ntTSL 222.6■■□□□ 1.217e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SLC4A2-213ENST00000483786 571 ntTSL 416.75■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SLC4A2-216ENST00000490898 702 ntTSL 314.41□□□□□ -0.17e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SLC4A2-206ENST00000466368 548 ntTSL 414.07□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 PSMC4-203ENST00000593455 1532 ntTSL 514.24□□□□□ -0.136e-9■■■■■ 28
PCBP2Q15366 PSMC4-206ENST00000601697 1623 ntTSL 213.91□□□□□ -0.186e-9■■■■■ 28
PCBP2Q15366 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.36e-9■■■■■ 28
PCBP2Q15366 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.46e-9■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SETD1A-202ENST00000452917 315 ntTSL 220.21■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 28
PCBP2Q15366 LIG1-204ENST00000542460 1527 ntTSL 216.5■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SORBS1-215ENST00000474353 2906 ntTSL 29.37□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SORBS1-201ENST00000277982 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.015e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.175e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.25e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.235e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.255e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.285e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.315e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.385e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.415e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TEX264-206ENST00000419358 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.96□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.981e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 KDM2A-213ENST00000531696 4160 ntTSL 510.42□□□□□ -0.745e-14■■■■■ 28
PCBP2Q15366 KDM2A-212ENST00000530342 3651 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.845e-14■■■■■ 28
PCBP2Q15366 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.647e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.627e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.197e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.137e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.927e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 LMO4-204ENST00000495705 565 ntTSL 319.14■□□□□ 0.655e-15■■■■■ 28
PCBP2Q15366 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.655e-15■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TIAM2-220ENST00000545347 506 ntTSL 319.01■□□□□ 0.638e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.577e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CD63-211ENST00000551173 788 ntTSL 318.26■□□□□ 0.517e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELOVL1-207ENST00000470968 867 ntTSL 517.89■□□□□ 0.457e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.449e-11■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TOM1-205ENST00000424387 2211 ntTSL 517.74■□□□□ 0.437e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SCAMP2-206ENST00000565345 790 ntTSL 517.74■□□□□ 0.437e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CD63-213ENST00000552164 845 ntTSL 217.71■□□□□ 0.437e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CLASRP-215ENST00000592056 582 ntTSL 217.69■□□□□ 0.427e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CLASRP-211ENST00000588247 599 ntTSL 217.52■□□□□ 0.47e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SOCS7-203ENST00000617360 2051 ntTSL 517.32■□□□□ 0.367e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.339e-11■■■■■ 28
PCBP2Q15366 KMT2B-204ENST00000592092 823 ntTSL 216.99■□□□□ 0.317e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.277e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.279e-11■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.267e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.167e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.17e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.19e-11■■■■■ 28
PCBP2Q15366 MNX1-205ENST00000474448 1101 ntTSL 515.63■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SCAMP2-208ENST00000566557 585 ntTSL 215.6■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SOCS7-204ENST00000617765 480 ntTSL 515.58■□□□□ 0.087e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.087e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 MNX1-203ENST00000428439 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.077e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.077e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TOM1-203ENST00000404284 2622 ntTSL 215.45■□□□□ 0.067e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELP5-205ENST00000570322 1083 ntTSL 315.37■□□□□ 0.059e-11■■■■■ 28
PCBP2Q15366 MNX1-202ENST00000425745 322 ntTSL 1 (best)15.35■□□□□ 0.057e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.035e-22■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CYTH3-206ENST00000478541 505 ntTSL 215.03■□□□□ -05e-15■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.027e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TOM1-212ENST00000456128 1133 ntTSL 514.79□□□□□ -0.047e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SCAMP2-210ENST00000569124 538 ntTSL 414.77□□□□□ -0.057e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.057e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SCAMP2-205ENST00000564529 866 ntTSL 214.68□□□□□ -0.067e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.095e-15■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.095e-15■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.117e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CD63-209ENST00000550050 829 ntTSL 514.22□□□□□ -0.137e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELOVL1-203ENST00000464204 1034 ntTSL 1 (best)14.17□□□□□ -0.147e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.147e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TBCE-205ENST00000472011 1840 ntTSL 214.12□□□□□ -0.157e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.157e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 URM1-206ENST00000483206 731 ntTSL 214.02□□□□□ -0.177e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TOM1-215ENST00000491987 852 ntTSL 513.99□□□□□ -0.177e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 IRF2-203ENST00000504340 565 ntTSL 413.96□□□□□ -0.177e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TBCE-206ENST00000482230 1050 ntTSL 513.8□□□□□ -0.27e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.27e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 IRF2-208ENST00000510814 568 ntTSL 413.73□□□□□ -0.217e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELOVL1-212ENST00000487209 828 ntTSL 213.73□□□□□ -0.217e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.227e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 IRF2-207ENST00000509274 591 ntTSL 413.46□□□□□ -0.257e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.267e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.269e-11■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.278e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CD63-203ENST00000546457 607 ntTSL 213.24□□□□□ -0.297e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 PLBD2-204ENST00000548997 465 ntTSL 313.23□□□□□ -0.297e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 URM1-205ENST00000470840 723 ntTSL 213.14□□□□□ -0.317e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELOVL1-214ENST00000497050 973 ntTSL 213.01□□□□□ -0.337e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 FGFR4-215ENST00000513423 445 ntTSL 212.97□□□□□ -0.332e-11■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.347e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 DDX27-204ENST00000484427 4929 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.357e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 IRF2-205ENST00000506230 498 ntTSL 212.43□□□□□ -0.427e-8■■■■■ 28
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 117.3 ms