Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN1Q15223 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN1Q15223 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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