Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms