Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLD3Q15054 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms