Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms