Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFIXQ14938 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIXQ14938 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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