Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BECN1Q14457 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BECN1Q14457 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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