Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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