Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1SQ13698 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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