Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL1Q13616 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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