Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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