Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOP3AQ13472 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOP3AQ13472 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms