Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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MKRN4PQ13434 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
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MKRN4PQ13434 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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MKRN4PQ13434 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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MKRN4PQ13434 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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MKRN4PQ13434 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MKRN4PQ13434 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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