Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.012e-12■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 ALG8-201ENST00000299626 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.082e-12■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 ALG8-214ENST00000530608 714 ntTSL 38.2□□□□□ -1.12e-12■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 ALG8-216ENST00000531213 517 ntTSL 27.48□□□□□ -1.212e-12■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 ALG8-206ENST00000525783 493 ntTSL 36.91□□□□□ -1.32e-12■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 ALG8-209ENST00000526849 612 ntTSL 26.57□□□□□ -1.362e-12■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 RPL36-208ENST00000590786 907 ntTSL 223.97■■□□□ 1.432e-55■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.557e-10■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.777e-10■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.097e-10■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.687e-10■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.046e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.766e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.666e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.599e-8■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.059e-8■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.129e-8■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.219e-8■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.289e-8■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 STX16-204ENST00000359617 4273 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.579e-8■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 STX16-203ENST00000358029 4329 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.619e-8■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 STX16-206ENST00000371132 4552 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.79e-8■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 STX16-NPEPL1-201ENST00000413559 557 ntTSL 38.36□□□□□ -1.079e-8■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 PFDN4-202ENST00000441080 579 ntTSL 57.13□□□□□ -1.279e-8■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-15■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.142e-15■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.488e-10■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.233e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.31e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.011e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 UBE2D3-209ENST00000394804 4166 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.361e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 UBE2D3-203ENST00000343106 2389 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.661e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 UBE2D3-208ENST00000394803 2227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.661e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 UBE2D3-224ENST00000508474 4819 ntTSL 27.78□□□□□ -1.161e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.681e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.222e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 MCRS1-204ENST00000547182 724 ntTSL 319.71■□□□□ 0.754e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.61■■□□□ 1.215e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 PNKD-205ENST00000469689 1372 ntTSL 220.72■□□□□ 0.915e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.75e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.355e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.065e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.925e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 PNKD-206ENST00000472650 472 ntTSL 25.97□□□□□ -1.455e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 C19orf70-205ENST00000590075 773 ntTSL 221.37■■□□□ 1.014e-13■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.214e-13■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.293e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 GUK1-239ENST00000498115 796 ntTSL 521.86■■□□□ 1.095e-7■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.577e-9■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 DCXR-221ENST00000585164 475 ntTSL 525.69■■□□□ 1.79e-11■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 ATP5L-203ENST00000527186 1582 ntTSL 25.16□□□□□ -1.581e-30■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.945e-8■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.15e-8■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 AC009779.3-201ENST00000551946 1024 ntTSL 214.83□□□□□ -0.045e-8■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 AC009779.3-203ENST00000257899 745 ntTSL 513.74□□□□□ -0.215e-8■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 AC009779.3-202ENST00000550412 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.395e-8■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 BLOC1S1-206ENST00000553100 421 ntTSL 211.62□□□□□ -0.555e-8■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 MVD-205ENST00000562981 537 ntTSL 220.55■□□□□ 0.882e-7■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 TMEM219-206ENST00000569481 443 ntTSL 314.51□□□□□ -0.092e-9■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.056e-28■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 USP14-202ENST00000383589 2168 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.286e-28■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 USP14-203ENST00000400266 1681 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.366e-28■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 UBR4-208ENST00000459947 3873 ntTSL 212.78□□□□□ -0.361e-13■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 AL137127.1-201ENST00000606379 3402 ntBASIC11.91□□□□□ -0.51e-13■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 UBR4-214ENST00000486515 536 ntTSL 38.09□□□□□ -1.111e-13■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RPL11-205ENST00000482370 879 ntTSL 1 (best)10.65□□□□□ -0.73e-42■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.252e-55■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC9.24□□□□□ -0.932e-55■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.411e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.751e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.591e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RBBP7-206ENST00000425696 373 ntTSL 57.22□□□□□ -1.251e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RBBP7-208ENST00000465244 4031 ntTSL 27.21□□□□□ -1.251e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RBBP7-201ENST00000330735 858 ntTSL 26.36□□□□□ -1.391e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.171e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 GET4-207ENST00000483469 370 ntTSL 222.04■■□□□ 1.125e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 EGLN2-205ENST00000593477 1391 ntTSL 221.52■■□□□ 1.041e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.971e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.491e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.471e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.42e-14■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 MAF1-206ENST00000534811 632 ntTSL 217.46■□□□□ 0.393e-10■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 EGLN2-216ENST00000599579 3894 ntTSL 215.45■□□□□ 0.061e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 PAFAH1B3-203ENST00000594989 649 ntTSL 514.1□□□□□ -0.151e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 AC136632.1-201ENST00000477964 591 ntBASIC14.07□□□□□ -0.165e-7■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 AC008537.1-201ENST00000601627 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.31e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 EGLN2-204ENST00000593445 3034 ntTSL 1 (best)12.35□□□□□ -0.431e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 RRP7A-201ENST00000323013 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.443e-9■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 ANAPC15-210ENST00000539395 563 ntTSL 55.9□□□□□ -1.461e-7■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 ANAPC15-215ENST00000545333 468 ntTSL 55.74□□□□□ -1.491e-7■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 SMUG1-219ENST00000511854 451 ntTSL 24.92□□□□□ -1.622e-6■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 WDR6-208ENST00000452875 3916 ntTSL 1 (best)12.56□□□□□ -0.41e-7■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.173e-7■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 AL133352.1-202ENST00000527595 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.52■□□□□ 0.43e-7■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.373e-7■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 AL133352.1-201ENST00000529568 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.78■□□□□ 0.283e-7■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.073e-7■■■□□ 18.5
PABPC4Q13310 AL133352.1-205ENST00000533549 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 414.18□□□□□ -0.143e-7■■■□□ 18.5
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