Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RESTQ13127 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RESTQ13127 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RESTQ13127 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RESTQ13127 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RESTQ13127 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RESTQ13127 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RESTQ13127 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RESTQ13127 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RESTQ13127 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RESTQ13127 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RESTQ13127 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RESTQ13127 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RESTQ13127 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RESTQ13127 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RESTQ13127 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RESTQ13127 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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