Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDZK1IP1Q13113 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms